futuristiche prospettive

Il Beijing Genome Institute (BGI) di Pechino possiede la struttura più futuribile per il sequenziamento dei genomi. Si pone come obiettivo quello di produrre 100 genomi di specie di primario interesse attraverso collaborazioni internazionali, offrendo la sua capacità di 150 sequenziatori di ultima generazione e 500 studenti a basso costo. Tra i genomi individuati, quello dell'idra immortale, la Turritopsis, già studiata dal gruppo del Prof. Ferdinando Boero (e Stefano Piraino) qui all'Università del Salento. Sarà una buona occasione di aumentare la visibilità dei nostri Enti di Ricerca del sud. E non solo, comparando il genoma con quello dell'idra pubblicato a marzo su Nature, si capirà quali differenze evolutive sono alla base di un comportamento di rigenerazione tessutale così radicale. D'altra parte gli istituti europei come l'EMBL continuano a procrastinare servizi di consulenza e sequenziamenti già prenotati da mesi, adducendo limiti strutturali e di macchinari oltre ogni ragionevole comprensione.

120 ettari saranno destinato a boschivo, ma non per alberi qualsiasi, bensì per 200.000 eucalipti geneticamente modificati dalla Florida al Texas, negli USA. Si tratta di alberi che difficilmente superano i climi freddi  se sottoposti a gelate invernali. Con il nuovo gene gli alberi saranno in grado di superare i rigidi inverni e accrescersi in fretta, producendo materia prima per i derivati della polpa di legno e per l'industria dle biodisel. La ArborGen è una ditta di biotecnologie di proprietà delle tre grandi industrie della carta, Int Paper, MeadWestCo USA, e Rubicon, Nuova Zelanda. 

Il via libera è arrivato da parte del Dipartimento per l'Agricoltura USA, ed in 27 siti si permetterà la coltivazione di alberi con produzione di infiorescenze.

Le maggiori critiche sono che si tratta di alberi che richiedono un elevato approviggionamento di acqua. Inoltre possono essere veicolo di funghi patogeni.

Non si tratta della  prima introduzione di alberi geneticamente modificati. In precedenza si sono prodotti una papaya resistente  a virus e alberi di prugno resitenti a virus. Però è il primo permesso che riguarda alberi forestali.

Dieci anni fa, la Commissione Europea avrebbe bocciato progetti di ricerca che riguardassero alberi di legno transgenici, adducendo il fatto che progetti di durata triennale non possono coprire le attività di crescita di alberi da legno, perchè si sviluppano più lentamente che in 3 anni. Oggi la produzione di alberi OGM è una realtà certa, fattibile anche in tempi rapidissimi...

Fondazioni

Alcune banche come la Banca S. Paolo hanno nel loro statuto "non per fini di lucro". Questo comporta che tutti i guadagni in bilancio siano investiti per finanziare attività sociali. Le Fondazioni quindi hanno atitvato programmi di investimenti nella ricerca "locale- regionale" e sono attive nel sostegno delle iniziative di eccellenza. La Fondazione CARIPLO ha lanciato dal 2003 il progetto NOBEL (Operative Network for Excellence in Lombardy biomedicine) che dal 2007 ha ampliato le sue aree di operatività grazie ad una compartecipazione della Cassa di Risparmio di Trento.

Il 14 giungo 2010 si terrà a Milano (Cariplo Centro Congressi, via Romagnosi 8) il smiposio "N.O.B.E.L. project Results" con la presentazione dei risultati delle attività finanziate nel 2007.

Gli argomenti finanziati sono "Controllo genetico ed epigenetico della stabilità del genoma", "Genomica funzionale delle cellule mielopoietiche", "Caratterizzazione delle cellule tumorali staminali", "Proteomica dei disordini correlati alla vecchiaia",  "Strumenti basati sulla genetica per l'analisi delle cellule staminali di topo", "Network per la generazione e l'uso di modelli animali per le malattie genetiche e per la loro terapia" e "Bioinformatica e modelli di regolazione genica".

Gli enti che hanno fruito dei fondi sono:

CNR- Istituto di Tecnologie Biomediche (2 donne scienziato)

CNR- Istituto di Genetica Molecolare 

Fondazione S. Raffaele (1 donna scienziato)

Fondazione Humanitas Roma 

Fondazione IRCCS Policlinico S. Matteo

Università  di Trento

Fondazione FIRC di Oncologia
Istituto Nazionale Neurologico "Besta"

Fondazione IRCCS Itituto Nazionale dei Tumori

Istituto Ricerche Mediche e biomediche Ronzoni

Istituto Mario Negri

Istituto sperimentale Spallanzani

Università degli studi di Milano (2 donne scienziato)

Università di Brescia

Università di Ferrara

auguri per i prossimi finanziamenti, anche il sud avrebbe bisogno di fondazioni bancarie....

al volo, sulla fusione nucleare

Due notizie fresche fresche sulla ricerca per la produzione di energia dal nucleare.

Un gruppo di studio per la Fusione Nucleare composto da scienziati russi e italiani, sarà finanziato per la costruzione dell'IGNITOR, alla stazione di ricerca termonucleare di Troitsk (accordo firmato a Milano il 26 aprile 2010). L'impianto avrà una forma a ciambella con buco (tokamak) di raggio 1.3 metri. Sarà più piccolo,  ma con campi magnetici più elevati, rispetto all'ITER, l'impianto di Fusione termonucleare localizzato a St. Paul lez Durance.

Intanto, alcuni problemi che hanno assillato la continuazione del progetto ITER stanno per essere risolti. Tra questi, il raddoppio dei costi per la costruzione dell'impianto. I sette membri del consorzio (Europa, Giappone, USA, Sud Corea, Cina, Russia e India) contano di completare l'opera per il 2016 ad un costo di 6.3 miliardi di dollari.

Il Giappone ha sostituito il vecchio capoprogetto, Kaname Ikeda, con Osamu Motojima, responsabile di precedenti progetti di fusione nucleare (Large Helical Device) a Toki. Si tratta della seconda sostituzione del management, dopo quella di Didier Gambier con Frank Briscoe.

Ricordi (Camillo)

 Il trapianto del pancreas endocrino - isole di Langerhans.

Camillo Ricordi è stato uno dei pionieri della cura del diabete da insufficienza di insulina, mediante la sostituzione delle cellule endocrine. Negli USA sono stati curati diversi pazienti, con buoni risultati anche nel tempo. Adesso Il Prof. Ricordi è uno dei componenti del comitato medico-scientifico di Thelethon e  dal  2004 ricopre l'incarico di Presidente del Consiglio d'Amministrazione di ISMETT.

L’azienda sanitaria V. Cervello di Palermo è l'azienda all’interno della quale è cresciuta e si è concretizzata l’idea di creare ISMETT.

L’ISMETT (Istituto Mediterraneo per i Trapianti e Terapie ad Alta Specializzazione) nasce come progetto di sperimentazione gestionale (art. 9 bis DL 502/92) nel 1997, grazie ad una partnership tra la Regione Siciliana, attraverso le Aziende Ospedaliere di Palermo "ARNAS Civico" e "Vincenzo Cervello", ed UPMC (University of Pittsburgh Medical Center).

L’UPMC (University of Pittsburgh Medical Center) è una multinazionale sanitaria integrata, con sede a Pittsburgh nello stato della Pennsylvania, e uno dei più importanti sistemi sanitari senza scopo di lucro degli Stati Uniti. Con 48.000 dipendenti 

L’Azienda di Rilievo Nazionale ad Alta Specializzazione (ARNAS) "Civico e Benfratelli – Giovanni Di Cristina – Maurizio Ascoli" di Palermo, è la più grande realtà sanitaria del sud.

Nel 1990 i laboratori di ricerca medica del Policlinico di Verona,  gruppo di trapianti del pancreas ha affiancato il S. Raffaele negli studi sui trapianti. Qui sono state effettuate le prime prove della macchina di estrazione delle isole pancreatiche dall'organo fresco, un dispositivo disegnato dal Prof. Radin. Formato da due semicapsule avvitate insieme, all'interno era allocato un filtro in metallo (sterilizzabile) in cui una metà conteneva il particolato con le isole pancreatiche e  pallini in acciaio per la frantumazione,  messa in contatto con una beuta per la digestione enzimatica a  temperatura controllata, tramite tubi in gomma per il ricircolo azionato da una pompa peristaltica. Lo scopo della struttura medica era quello di trasferire, una volta arrivati organi da donatori deceduti, le isole purificate ai pazienti in attesa di trapianto. La difficoltà maggiore quella di mantenere la sterilità durante i vari passaggi, e inoltre di evitare il rigetto del trapianto con farmaci immunosoppressori. Oggi la possibilità di produrre cellule staminali da far differenziare in isole pancreatiche sta soppiantando questo metodo.

ricordi

Scrivevo un commento sul blog "Dannati Danni" e ne sono uscite fuori delle associazioni di idee, ricordi. Il commento diceva "ricordo un primario di endocrinologia, depresso, a Verona, che inscenò un suicidio in reparto, e invece di tagliarsi l'arteria carotidea si tagliò la vena giugulare, così tanto per farsi soccorrere...".

Sbagli intenzionali, e altri come lapsus freudiani.  Su tutti campeggiano gli sbagli specchio... tu guardi nello specchietto una macchina parcheggiarsi, e il guidatore esce a destra: momento di straniamento, come io sto a sinistra, poi fai più attenzione, ci ragioni e capisci. Sinistro al posto di destro, per intenderci. Tipici errori originati da una lastra, guardata al contrario.  Asportato lobo tiroideo sbagliato (sempre a Verona). L'ultimo in ordine di tempo è stato un intervento ad un testicolo che ha lasciato al suo posto quello col tumore, e dire che le dimensioni in questo caso avrebbero dovuto aiutare...

Poi ci sono gli errori di quelli che proprio non ci vogliono credere, e quindi non ti danno retta. E ti lasciano di stucco.  E' successo ad un ragazzo di 26 anni, di queste parti. Va al pronto soccorso, dice: sono un infermiere, ho i sintomi di un infarto, portatemi in cardiologia", "no, ma che dice, non è niente, lei è dimesso!"

Dopo un'ora, l'attacco vero e  proprio, per fortuna in un altro pronto soccorso, adesso non lavora più come infermiere, ha dovuto cambiare stile di vita, ma è ancora vivo....

carrubi

Avevo acquistato farina di carrube (di semi, ed una confezione di farina di polpa) da usare come addensante in laboratorio. Poi ho visto che è usata molto in cucina, nelle salse e nei dolci. Ho acquistato quindi il cioccolato di Modica, con una elevata percentuale di farina. Buooono...

I semi di carruba sono "un meraviglioso dono della natura", infatti essi rappresentano una miniera inesauribile di una vasta gamma di utilizzazioni industriali. 

L'episperma è molto ricca di acido tannico e di sostanze coloranti, ma la parte più importante del seme è l'endosperma, che è molto ricco di carrubina ad altissima viscosita', ha la proprietà di assorbire fino a 40 volte il suo peso secco. Viene usata quale addensante, legante, stabilizzante, flocculante, sospendente, filmogene, impermeabilizzante, eccipiente, omogeneizzante, agente di sedimentazione, agente di filtrazione, nelle industrie alimentari, tessili, cartarie, etc.

Attualmente la mia gatta fa uso di una pasta a base di questo prodotto naturale, aiuta a stabilizzarle le funzioni intestinali...

  Il nome deriva dall’Arabo Kharrub (o charnub), è una pianta longeva, sempreverde, imponente, può raggiungere i 10-12 m, con suggestiva e vistosa chioma verde scura. Le radici ricavano dalle fessure delle rocce acqua ed elementi nutritivi. I fiori per trasformarsi in frutti impiegano un anno, l’albero dopo la raccolta ha già i fiori per la successiva fruttificazione. Il frutto si sviluppa in primavera per poi maturare in agosto-settembre.

Qui nel Salento, ci sono alberi sparsi nel territorio, ma non una vera coltivazione. Alberi sia maschi (senza cornule) che femmine (le cornule attirano gli animali, e molti preferiscono piantare alberi senza frutto)
Il carrubo preferito da chi vuole un giardino pulito è la pianta maschio, non fruttifica, ed i frutti attirano gli animali, roditori.... da una pianta adulta si possono raccogliere 200 kg in un anno.

Le varietà di carrubo femminili più diffuse in Sicilia sono la "Latinissima", la "Racemosa", la "Morescona", la "Saccarata" e la "Falcata". La prima conosciuta anche con il nome di "Giubiliana" a Scicli, di "Cipriana" a Modica e di "Masculina" a Noto.  Il  frutto, di lunghezza media, è di colore bruno tendente al nero ed è meno zuccherino delle altre cultivar femminili. La "Racemosa" detta anche "Moresca" a Scicli e a Modica, o "Carruba spada" o "Sciabulara" a Noto, è una pianta di sviluppo inferiore. Il frutto, la cui lunghezza media è inferiore a quella delle altre cultivar siciliane, è di colore marrone scuro e con un contenuto zuccherino molto elevato. Il frutto, la cui lunghezza media è inferiore a quella delle altre cultivar siciliane, è di colore marrone scuro e con un contenuto zuccherino molto elevato. La "Morescona", diffusa a Scicli, viene descritta come una sottovarietà della Racemosa, e si distingue da questa solo per la fruttificazione più abbondante e più costante. La "Saccarata" (sinonimi: "Latina", o "Fimminedda" o "Milara") era in passato molto diffusa; oggi è stata abbandonata perché produce meno e saltuariamente rispetto alle altre specie. La pianta ha un portamento maestoso, con ramificazioni fitte e nodose, per cui risulta rivestita da un ricco manto di foglie. La produzione è a grappoli. Il frutto è diritto e leggermente incurvato, e la sua polpa è soffice e pastosa e di color miele con un buon contenuto di zuccheri. La "Falcata" (sinonimi: "Fauciara" a Rosolini o "Francisa") è formata da una pianta di grande sviluppo, la cui produzione è alternante e poco rilevante. I frutti sono a forma di falce, lunghi, poco polposi, poco zuccherini, paragonabili a quelli prodotti dalle piante semiselvatiche. Una varietà di carrubo ermafrodita è l'"Ermafrodita Tantillo", coltivata nella contrada Margioni di Frigintini (fraz. di Modica) nell'azienda Tantillo. La pianta è a portamento assurgente, con internodi lunghi. La produzione è elevata e costante. Le foglie sono di media lunghezza. Il frutto di media lunghezza è costituito da una polpa soffice, di colore chiaro, mediamente zuccherina ed un po' astringente.

Alcuni carrubi sono secolari.

Queste foto sono fatte a Gagliano (incrocio per Castrignano), altri alberi maestosi si trovano nelle campagne di Salignano

sotto: davanti all'ospedale di Gagliano

 Peonia in fiore

fisica dell'acqua

L’acqua è un liquido strano. A differenza di altri liquidi, diventa meno densa quando congela: non è più densa a 0 °C, il punto di congelamento, ma a 4 °C. Ci sono altre anomali proprietà, alcune cruciali per il comportamento nell’ambiente. Il ghiaccio galleggia sull’acqua, i laghi non gelano sul fondo. Questo comportamento deriva dai deboli legami chimici, i legami idrogeno, che rendono le molecole d’acqua aggregate nel liquido. Nel ghiaccio, questi legami tengono le molecole a più grande distanza, lasciando maggiore spazio tra le molecole. In alcuni insetti, e nei pesci antartici, animali a sangue freddo vivono a temperature estreme, sono presenti proteine con proprietà anticongelamento. Queste proteine anti-freezing hanno l’abilità di prevenire la formazione di ghiaccio attraverso uno abbassamento della temperatura di transizione a ghiaccio. La separazione delle temperature di fusione e di congelamento si chiama isteresi termica. La temperatura di crescita del ghiaccio si chiama isteresi del punto di congelamento. Questa isteresi sembra causata dall’assorbimento delle proteine anticongelamento sulla superficie del cristallo, che ha come conseguenza che il ghiaccio cresce in regioni con superficie convessa compresa tra le proteine anti-freeze adiacenti adsorbite, così da abbassare la temperatura in cui il cristallo può espandersi in modo visibile.

Uno stato della materia è lo stato di aggregazione della materia a seconda delle sue proprietà meccaniche. I tre stati più noti in natura sono stato solido, stato liquido e stato gassoso. Nella scienza moderna in realtà si sono osservati nuovi stati, riferiti a numerose possibilità che ha la materia di organizzarsi. Il plasma, vari tipi di ghiaccio, lo stato superfluido (elio a bassissime temperature), supercritico, superconduttivo, colloidale, di cristallo liquido, ecc....

Punto triplo e Stato supercritico Il punto triplo è determinato dai valori di temperatura e pressione in cui coesistono tre fasi di aggregazione:liquido, solido, e aeriforme. I valori di temperatura e pressione che identificano i punti tripli dipendono solamente dalla sostanza in esame. In condizioni di temperatura superiore alla temperatura critica e pressione superiore alla perssione critica,  le proprietà di un fluido sono in parte analoghe a quelle di un liquido (ad esempio la densità) ed in parte simili e quelle di un gas (ad esempio la viscosità).

Diagramma di stato della CO2. In rosso: diagramma di fase del ghiaccio secco. In grigio: CO₂ gassosa. I fluidi nello stato supercritico a base di anidride carbonica trovano applicazione come solventi industriali, in sostituzione di quelli organici. Le estrazioni possono essere rese selettive controllando la densità del mezzo ed il materiale estratto è facilmente recuperato abbassando la pressione, permettendo al fluido supercritico di ritornare alla fase gassosa ed evaporare.

Molte sostanze, tra le quali l'acqua, hanno più di una fase solida (polimorfi), cosicché i loro diagrammi di fase presentano più punti tripli solido-solido-liquido o solido-solido-solido. L'acqua può rimanere allo stato liquido anche sotto 0 °C a causa del fenomeno di soprafusione (fino a -42 °C) oppure con pressioni superiori a quella normale (fino a -30 °C); viceversa il ghiaccio può formarsi anche a temperature superiori a 0 °C con pressioni inferiori a quella normale. Esistono 14 differenti fasi solide dell'acqua, ma la più comune è la I_h, che è l'unica presente nella biosfera. Il ghiaccio Ih è una forma a cristalli esagonali di ghiaccio, costituita da acqua congelata. Il ghiaccio I_h ha una densità inferiore rispetto all'acqua liquida, pari a 0,917 g/cm³ (per questo gli iceberg e i lastroni di ghiaccio galleggiano su laghi e oceani), a causa della densità estremamente bassa del suo lattice cristallino. 

Il punto di fusione dell'acqua corrisponde ad una temperatura di 0 °C. Per convertire questo valore in gradi Kelvin, bisogna sommare a questo valore 273,15, per cui:

 "temperatura termodinamica del punto triplo dell'acqua" è la differenza di temperatura fra lo zero assoluto (pari a -273,15 °C) e il punto triplo dell' acqua (0,01 ° C), o zero gradi Celsius, in senso comune.

Su questo punto ritorno più avanti, comunque teniam oa mente che:

ciò si riferisce ad acqua avente una composizione isotopica definita esattamente dai seguenti rapporti di sostanze: 0,00015576 moli di ²H per mole di ¹H, 0,0003799 moli di ¹⁷O per mole di ¹⁶O, e 0,0020052 moli di ¹⁸O per mole di ¹⁶O". Questo perché variazioni nelle concentrazioni (minime, come si vede dalla precisazione) di isotopi dell' idrogeno(H) e dell'ossigeno (O) nell'acqua comportano variazioni nella temperatura del suo punto triplo che non sono tollerabili oggi nella definizione di questa unità di temperatura.

che importanza ha la composizione in sali, la purezza, lo vedremo in seguito

Questo post partecipa al 7 Carnevale della Fisica, ospitato in questa edizione sul blog di Aldo Ficara  e suddiviso per regioni di appartenenza dei contributi (vedi Puglia)

Nel 1992, Gene Stanley alla Boston University attraverso simulazioni al computer ha scoperto che i legami idrogeno nelle molecole di acqua possono produrre due differenti tipi di liquido comprimendo  l’acqua  a alte pressioni durante un congelamento spinto. In una forma, i legami idrogeno creano un network aperto, disperso di molecole, chiamato liquido a bassa densità. Nell’altra, le molecole d’acqua sono compresse e ravvicinate, al costo di rompere alcuni legami a idrogeno, formando un liquido ad alta densità. 

Nino Leporini dell’Università di Pisa e i colleghi dell’Indian Institute of Science di Bangalore dicono di avere osservato le due fasi preannunciate da Stanley nel 1992.

Parte del problema è che le due forme elusive  fasi liquide sono difficili da studiare perchè l’acqua tende a ghiacciare prime che possa essere super-raffreddata a temperature intorno a  –75 °C. Nel 1998 Stanley e colleghi osservarono un  interessante indizio della transizione liquido–liquido quando fusero minuscole particelle di ghiaccio per compressione.

Nel 2007, Francesco Mallamace e cooleghi dell’ Università di Messina riferirono di  segni dei due tipi di acqua super-raffreddata confinati entro pori di  silicato così piccoli  che il liquido non riusciva a congelare. Queste scoperte sono state esposte a critiche perchè il comportamento dell’acqua  potrebbe essere alterato dalle superfici dei pori di silicato: “quello che gli autori osservano non è acqua pura, ma ciò che rimane quando la maggior parte dell’acqua è cristallizzata via”.  

Debenedetti asserisce che i risultati sembrano rivelare due differenti tipi di acqua, le cui percentuali cambiano al variare della temperatura.  Però egli non crede che ci sia ancora evidenza che questi due tipi siano due distinte fasi, come cubetti di ghiaccio dentro un bicchiere d’acqua. Questi due tipi di liquido si interconvertono gradualmente, invece che rapidamente.

Un’altra critica  paragona il fenomeno all’acqua marina, che espelle il sale quando ghiaccia,  allo stesso modo piccole vene di acqua tra i cristalli di ghiaccio possono contenere tutta una sorta di residui.  "Il liquido che gli autori osservano non è acqua pura,  ma quello che rimane quando la maggior parte delll’acqua è cristallizzata via”.  "La sua  composizione è ignota. 

Se questa proprietà fosse confermata, ci sono implicazioni interessanti, come acqua super-raffreddata tra il ghiaccio può contenere tracce di vita nelle regioni polari, o in pianeti molto freddi.

Un  articolo del 2010 discute l’esistenza di transizione vitrea e comportamento rilassato di un volume d’acqua, e una possibile relazione alla acqua confinata in uno spazio limitato (confinamento in nanopori).  

Data la difficoltà di studiare lo stato dell’acqua a temperature comprese tra  150 and 235 gradi Kelvin, ci sono dubbi sull’esistenza di un volume d’acqua super-raffreddata.  

L'acqua non è tutta uguale. A livello fisico e chimico presenta un'enorme variabilità. Ma anche due acque che hanno le stesse proprietà chimiche e  fisiche possono essere molto diverse tra loro. Fino ad alcuni anni fa queste tesi erano sostenute da fautori delle discipline olistiche e naturali, ma  rifiutate dalla scienza. Ma Masaru Emoto ha inventato un procedimento scientifico per dimostrare che l'acqua è influenzata da inquinamento, ed altri influssi di energia. Lo scienziato giapponese ha messo a punto una tecnica per esaminare al microscopio e fotografare i cristalli che si  formano durante il congelamento di diversi tipi d’acqua. Ha fotografato, acqua di montagna, acqua inquinata, ecc. mostrando che i cristalli dell´acqua trattata muta di struttura. 

Bibliografia 

1. Poole, P. H. et al., Nature 360, 324-328 (1992). Banerjee, D. et al. Proc. Natl Acad. Sci. USA, doi:10.1073/pnas.0900734106 (2009). 
2. Mishima, O. & Stanley, H. E. Nature 392, 164–168 (1998). 
3. Mallamace, F. et al. Proc. Natl Acad. Sci. USA 104, 424-428 (2007). 
4. Koga, K et al. Nature 2000, 408, 564-567. 
5. Swenson J, Teixeira J. The glass transition and relaxation behaviour of bulk water and a possible relation to confined water. J. Chem. Phys. 2010, 132:014508. 
6. Liu et al. Liquid-solid transition of confined water in silica-based mesopores. J Phys Chem B. 2010, 114: 4145-50. 
7. Kastelowitz N, Johnston JC, Molinero V. The anomalously high melting temperature of bilayer ice. J Chem Phys. 2010, 132:124511. 
8. Kristiansen E, Zachariassen KE. The mechanism by which fish antifreeze proteins cause thermal hysteresis. Cryobiology. 2005; 51(3):262-80.

numeri in biologia

I numeri e i loro rapporti matematici sono un mezzo con cui vengono presentati i risultati delle ricerche, la rappresentazione degli eventi. In particolare il 3 è un termine di paragone, la riproducibilità di un esperimento (in tutti gli articoli un risultato è creduto quando un esperimento è ripetibile, per tre volte porta ad uguali effetti, ed è verificabile anche presso altri laboratori). Dati 3 numeri leggermente differenti come misura di questi effetti, si calcola quindi il valore medio (rappresentato come l'altezza di un parallelepipedo nei grafici (x, y=fx) e la deviazione standard come un trattino che fluttua sopra e sotto il valore medio come nella figura qui schematizzata: 

 

In statistica la media  (intesa come media "aritmetica")  viene applicata soltanto nella statistica descrittiva

La formula della media aritmetica semplice N è:

somma dei valori (X₁ + X₂ + …. X_n) diviso n  Tradurre la statistica ed il rischio in maniera comprensibile da tutti è un modo per bloggare bene e comunicare la scienza  sostenendo l'evidenza attraverso dati quantitativi, qualitativi, o entrambi.

Rischio Individuale verso rischio nella populazione

spesso abbiamo sentito delle  stima nel corso della vita del tumore al seno nelle donne.  La percentuale fluttua in modo vario a seconda della località, mondo occidentale verso pasei in via dis sviluppo, tra il 3% fino al 14%.

Negli USA, è il 12.7 per cento il numero delle donne che avranno questo tumore ad un certo momento della loro vita.   Questa statistica vien spesso riportata come "una donna in otto avrà un cancro al seno". Per i lettori è difficile comprendere il rischio da questi numeri. L' 80% delle donne americane pensa che una donna su otto sarà così diagnosticata ogni anno.

Riportare la statistica 'una su otto' mis-rappresenta il rischio individuale.

Nel corso della vita, in ogni donna l'attuale rischio di tumore al seno  varia per diversi parametri. 

Negli USA  0.43% delle donne comprese  tra 30 e 39 anni (1 su 233) sarà diagnosticata così.  

Nelle donne  tra 60 e 69 anni, il tasso è di 3.65% (1 su 27).

 Stime di rischio assoluto e rischio relativo.  

 Bisogna scegliere se riportare il rischio assoluto o il rischio relativo, perchè la percezione che ne hanno i lettori li fa apparire sostanzialmente differenti.

Absolute risk è semplicemente la probabilità che qualcosa succeda  (per esempio,  il dato una donna su otto).

  Relative risk è il paragone tra il rischio in due situazioni differenti.

Immaginiamo un ostudio che riporti  un nuovo vaccino sulla frebbe di dengue. Lo studio presenta due gruppi  seguiti, di 1000 Brasiliani che hano avuto il vaccino  o un placebo. Dopo 5 anni, una  persona vaccinata contrae la febbre, comparata a 4 persone non vaccinate.

Il rischio assoluto di avere il dengue  dopo il nuovo vaccino e dello  0.1 %, mentre è dello  0.4 % col placebo. I Titoli riportanti "Nuovo vaccino diminuisce il rischio del dengue dello 0.3 per cento" non danno nessuna notizia.

Per il rischio relativo  il dato è molto diverso. Il nuovo vaccino abbassa il rischio relativo del 75 per cento, comparato al placebo. "Nuovo vaccino diminuisce il rischio del dengue del 75 per cent", è un titolo che riceverà molta attenzione nei lettori Brasiliani.

 Analisi rischi/benefici

Questa differenza puè nella realtà essere molto piccola, dipende da quanto comune sia la malattia. Se una malattia colpisce solo 4 persone su un milione, diminuire il rischio del 75% salverà solo  tre persone su un milione. (Fonte: SciDevNet)

Matematica statistica per biologi

Alcune funzioni, calcolabili con un software di statistica, per affermare la significatività dei dati ottenuti (dati statistici vengono richiesti nelle pubblicazioni)

 Il test t di Student viene sempre calcolato sui dati per convalidare i risultati biologici, come una  verifica d'ipotesi su un valor medio  

la varianza di una variabile aleatoria X è un numero Var(X) che fornisce una misura di quanto siano vari i valori assunti dalla variabile, ovvero di quanto si discostino dalla media

La deviazione standard (in inglese: standard deviation) o scarto tipo o scarto quadratico medio è  derivato direttamente dalla varianza, misura la dispersione dei dati intorno al valore atteso.  In statistica la precisione  si può esprimere come deviazione standard, viene rappresentato con la lettera greca σigma.

Significance test

p < 0,005. P inferiore al 0.5%.

In statistica inferenziale il valore p (o p-value, in inglese) di un test di verifica d'ipotesi condotto indica la probabilità di ottenere un risultato pari o più estremo di quello osservato, supposta vera l'ipotesi nulla (l'ipotesi sulla quale si conduce il test). Talvolta viene anche chiamato livello di significatività osservato.

Per condurre un test statistico è importante fissare il livello di significatività prima di calcolare il valore p. Se il valore p venisse calcolato per primo, lo sperimentatore saprebbe quali valori per il livello di significatività conducono ad accettare o rifiutare l'ipotesi nulla, e potrebbe scegliere il livello in funzione del risultato desiderato.

Il valore p viene utilizzato per fornire maggiori informazioni su un test rispetto all'accettazione o al rifiuto per un certo livello di significatività.

Sia, per esempio, 3% (o 0,03) il valore p di un test. Il test condotto con un rischio di errore (o livello di significatività) del 5% induce allora a rifiutare l'ipotesi nulla, mentre lo stesso test condotto con un rischio di errore del 2% induce a non rifiutare l'ipotesi nulla. 

La conclusione "il valore p è 3%" contiene più informazioni delle sole "ipotesi rifiutata con significatività 5%" o "accettata con significatività 2%".

Il Rischio riguarda il valore atteso di uno o più risultati di uno o più eventi futuri. Il rischio, come valore di questi risultati, può essere negativo (downside risk: il sopraggiungere di un costo aggiuntivo), oppure positivo (upside risk: mancato raggiungimento di un beneficio atteso). L’uso generale tende a mettere a fuoco solo i danni che possono sopraggiungere dai futuri eventi.

Catalpa fiorita

Ecco un incontro inaspettato durante la pausa pranzo....

la Catalpa in fiore ha un profumo intenso, che disperso nell'aria sembra inebriante
questo esemplare di qualche decennio presenta ancora gli acheni dell'anno trascorso

si trova vicino al museo dell'ambiente ed alla mensa, sul percorso interno del campus Ecotekne.

opportunità all'European Science Foundation

Posizione "giovane" con master o Dottorato in scienze umanistiche....
Anthropology, Archaeology, Art, Art History and Arts, Classical studies, History ,History and Philosophy of
Science, Literature and Literary Studies, Languages and Philologies, Linguistics, Music and Musicology, Oriental
and African Studies, Pedagogical and Educational Research, Philosophy, Psychology, Religion and Theology
Specific competencies
• PhD/Master’s degree and preferably with a further 1-2 years’ research experience in a relevant science area;
• Basic knowledge of European and national research structures and institutions and European and international science policy;
• High standard of spoken and written English, with a working knowledge of another European language an advantage;
• Ability to draft under supervision concise and clear scientific documents;
• Good working knowledge of MS Office systems and of electronic databases and Web sites.
This full time position is offered for a 6 month contract (with possible extension) preferably starting May or 1 June 2010.
The place of work is Strasbourg, France.
The salary level will be based on experience and qualifications of the successful candidate and will follow ESF terms and conditions.

Please send your application (cover letter + CV) by 3 May 2010 to jobs@esf.org quoting the following reference JSO - HUM.

Interviews will be held in Strasbourg on 7 May 2010.