Eccellenze della ricerca italiana: Carlo Croce, George Calin, Manuela Ferracin

 Oggi mi sono collegato ad un webinar interessante, (per problemi di virus, hanno doovuto interrompere) organizzato dal Journal of Translational Genetics and Genomics: MicroRNAs and Long Non-coding RNAs in Genetic Diseases

webinar tenuto da due eccellenze della ricerca prestati agli USA, Carlo Croce, del Dipartimento di biologia dei tumori dell'Ohio State University, Columbus, e da George A. Calin, di origini rumene, che ha studiato presso l'univeristà di Ferrara per il dottorato, ed oggi lavora al Department of Translational Molecular Pathology, Division of Pathology/Lab Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston. Interverrà anche l'italianissima Manuela Ferracin, del gruppo di Massimo Negrini, e professoressa all'università di Bologna. 

E' rimarchevole l'ottima qualità delle loro pubblicazioni, e il ranking, ossia l'indice H che hanno raggiunto

Prof. George Calin is  Professor of Department of Translational Molecular Pathology, Division of Pathology/Lab Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center; Co-Director, The RNA Interference and non-codingRNA Center, The University of Texas MD Anderson Cancer Center; Co-Director, MD/PhD Program, The University of Texas, Graduate School of Biomedical Sciences. Prof. Calin was the first to discover the link between human cancers and microRNAs, a finding considered as a milestone in microRNA research history. He has now developed starting from July 2007 an independent research group at the M.D. Anderson Cancer Center in Houston and produced a new advance by linking new classes of non-coding RNAs to cancer. He is presently a Professor in Department of Translational Molecular Pathology at MDACC and studies the roles of microRNAs and other non-coding RNAs in cancer initiation and progression and in immune disorders, as well as the mechanisms of cancer predisposition linked to ncRNAs. Furthermore, he explores the roles of body fluids miRNAs as potential hormones and biomarkers, as well as new RNA therapeutic options for cancer patients. He has published over 600 scientific articles in prestigious journals, has been cited over 139,000 times (Google Scholar) and has received numerous awards and honors for his groundbreaking work in cancer research. He is the Highly Cited Researcher in the field of Clinical Medicine, ASCI Membership, American Society for Clinical Investigation, etc.

Prof. Croce is the John W. Wolfe Chair in Human Cancer Genetics, The Ohio State University; Member of The National Academy of Sciences, the National Academy of Medicine, the Institute of Medicine of the National Academies, and the National Academy of Inventors; Fellow of the American Academy of Arts and Sciences, and the American Association for the Advancement of Science.

Prof. Croce is an Italian-American molecular geneticist and professor of medicine at Ohio State University. Renowned for his investigations of cancer pathogenesis, Prof. Croce has provided valuable insights into the underlying, genetic basis of cancer onset. His research has established genetic links to a variety of cancers including Burkitt's lymphoma, T-Cell lymphoma, and acute leukemia. He is a pioneer in the unraveling of the molecular basis of a number of lymphoma and leukemia cancers. In addition to his studies involving genes such as ALL1 and TCL1, Prof. Croce was the first investigator to discover and sequence BCL2. He later defined a role for this protein in various lymphomas such as follicular lymphoma. More recently, Prof. Croce's work has centered on understanding the role of micro RNAs in cancer pathogenesis. His research has proved that particular micro RNAs have the potential to exhibit either oncogenic or tumor suppressive properties. He has published over 1000 research papers and has been cited over 270,000 times (Google Scholar), making him one of the most highly cited researchers in the world.

Prof. Croce has received numerous awards and honors for his contributions to cancer research, including Charles S. Mott Prize from the General Motors Cancer Research Foundation (1993), the Scientific Excellence in Medicine Award from the American-Italian Cancer Foundation (1997), the Honor of Merit of Italian Republic (2000), the Henry M. Stratton Medal by the American Society of Hematology (2007), the Outstanding Investigator Award from the National Cancer Institute (2015); the Margaret Foti Award (2017), etc.

Dr. Ferracin is the Associate Professor, Department of Medical and Surgical Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy.

Dr. Ferracin has a strong background in molecular oncology, with a specific expertise in the identification of diagnostic or prognostic gene signatures. As a PhD student in Prof. Negrini's lab, she collaborated with Prof. George Calin and Prof. Carlo Croce, when they published the first papers showing an association between microRNAs and cancer. They developed the first microarray for microRNA expression analysis. She applied this novel technology to the discovery of microRNAs and non-coding RNAs involved in leukemia, breast cancer and other solid tumors (PNAS, 2004; NEJM, 2005; CancerCell, 2007). In 2012, she obtained the prestigious "My First AIRC Grant" to study circulating microRNAs in biological fluids of cancer patients. She identified cancer-specific signatures of cell-free microRNAs for cancer diagnosis. Following her recruitment as Professor at the University of Bologna in 2016, she established her independent research group and obtained a grant as PI from Bologna University (Almaidea), to study methylation alteration in stage II colorectal cancer (CancerLett, 2018). She is currently working on the identification of melanoma prognostic biomarkers and the development of patient-derived cancer models.

Ai tempi d'oro della ricerca sui microRNAs, gli studi di espressione mediante DNA arrays si facevano fare negli USA, presso il laboratorio pionieristico, tramite questi contatti e conoscenze. Anche il mio amico Massimo Mallardo, titolare di un progetto per giovani ricercatori del VI programma quadro EU, aveva svolto uno studio su miR-7a, e sul differenziamento di linee leucemiche mediante ATRA, acido retinoico. Nel 2003 avevamo iniziato il progetto STREP della EU dal titolo RIBOREG "Novel roles od non-coding RNAs in development and disease", in questa occasione abbiamo unito le forze con Massimo Mallardo, per portare insieme i nostri risultati al meeting di conclusio del progetto e  insieme Trans-project meeting sugli RNA della Commissione Europea, nel 2007, a Carry Le Rouet. Una review fu sottomessa al giornale dell'ospedale Regina Elena, Journal of Experimental Clinical Cancer Research, valutato dal gruppo americano di editors, che però vide la luce solo nel 2008 quando il giornale entrò nella lista di riviste con impact factor di Scopus. 

Mallardo M, Poltronieri P, D'Urso OF. Non-protein coding RNA biomarkers and differential expression in cancers: a review. J Exp Clin Cancer Res. 2008 Jul 16;27(1):19.

Il lavoro sulle linee leucemiche differenziate con Acido Retinoico uscì nel 2010, con la partecipazione di Manuela Ferracin.

Rossi A, D'Urso OF, Gatto G, Poltronieri P, Ferracin M, Remondelli P, Negrini M, Caporaso MG, Bonatti S, Mallardo M. Non-coding RNAs change their expression profile after Retinoid induced differentiation of the promyelocytic cell line NB4. BMC Res Notes. 2010 Jan 27;3:24.

Con George Calin abbiamo pubblicato due grosse review, di cui sono l'autore principale nel senso di colui che la ha scritte, 

Farooqi AA, Fuentes-Mattei E, Fayyaz S, Raj P, Goblirsch M, Poltronieri P, Calin GA. Interplay between epigenetic abnormalities and deregulated expression of microRNAs in cancer. Semin Cancer Biol. 2019 Oct;58:47-55.

Farooqi AA, Fayyaz S, Poltronieri P, Calin G, Mallardo M. Epigenetic deregulation in cancer: Enzyme players and non-coding RNAs. Semin Cancer Biol. 2022 Aug;83:197-207

Già nel 2015 ci eravamo sentiti per uno special issue sul giornale Current Genomics, di cui ero guest editor, e inviarono contributi sia Sonia Melo, del gruppo di George Calin

EDITORIAL Implication of Non-coding RNAs in Cancer Biology and Cellular Physiology. Palmiro Poltronieri. Curr Genomics. 2015 Oct; 16(5): 294. 

Silva M, Melo SA. Non-coding RNAs in Exosomes: New Players in Cancer Biology. Curr Genomics. 2015 Oct;16(5):295-303

sia Maria Ciccone, George Adrian Calin MicroRNAs in Myeloid Hematological Malignancies. Curr Genomics. 2015 Oct; 16(5): 336–348. 

nel 2016 ancora guest editor, per MicroRNAs, ho reclutato di loro per raccolgiere alla fine sei contributi

"This special issue intends to bring an update on microRNA topics, presenting six contributions. Massimo Mallardo discusses the role of miR-25 and its targeted genes in development of human cancer. Maria Ciccone and George Calin review the findings on microRNAs in chronic lympocytic leukemia. Charles Lawrie reviews the links between deregulated expression of microRNAs and B-cell lymphomas. Binlian Sun contributes with a review on the role of microRNAs in HIV-1 replication and latency. Xiao-Min Leng reviews several cases of miRNA-dependent activation of mRNA translation. Finally, Marek Sanak introduces new data on miR-29c-3p as a biomarker of abdominal aortic aneurysm, in patients undergoing elective surgery". MicroRNA, 2016, Vol. 5, No. 2

Nuova pubblicazione prodotta al CNR-ISPA Lecce

"Structures of mammalian ER α-glucosidase II capture the binding modes of broad-spectrum iminosugar antivirals", l'ulitmo prodotto della ricerca dell'ISPA di Lecce, accettato su Proceedings of National Academy of Sciences USA, propone l’uso della pianta come sistema modello per lo screening di potenziali antivirali umani.
Complimenti  ai collaboratori che hanno ottenuto questo  risultato davvero brillante.

Ecco la lista degli autori:
Alessandro T. Caputo1, Dominic S. Alonzi1, Lucia Marti2‡, Ida-Barbara Reca2‡, J. L. Kiappes1, Weston B. Struwe1, Alice Cross1, Souradeep Basu1, Edward D. Lowe1, Benoit, Darlot1,3, Angelo Santino2, Pietro Roversi1* & Nicole Zitzmann1*
1: Department of Biochemistry, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU, United Kingdom. 2: Institute of Sciences of Food Production, C.N.R. Unit of Lecce, via Monteroni, 73100 Lecce, Italy. 3:Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier, 8 Rue de l'Ecole Normale 34296 Montpellier CEDEX 5, France.

 

A me il merito di aver messo insieme i due team e di aver finanziato sul mio progetto l'assegno di ricerca di Barbara, e di essere riuscito a ottenere la sua estensione dal Direttore (2014-2016), in attesa che arrivino i soldi del conguaglio al CNR.
Ecco le corrispondenze scambiate con Roversi:

la ricerca e gli enti di governo

Avevo postato un commento sui fondi alla ricerca in Puglia.
Quando mi chiedono sul mio lavoro di ricercatore, se sia presso l'Istituto più famoso in Italia ed all'estero (Nanotechnology National Laboratory di Lecce) rispondo che purtroppo no, mi occupo di piante e produzioni alimentari tipiche, e di prodotti nuovi. Però i rapporti con Nanotecnologie sono stretti, perchè da una parte NNL possiede strumentazioni di prima qualità e moderne, dall'altro perchè per NNL è utile lavorare con esperti nel campo biologico/ genetico (nella foto, alcuni ricercatori italiani dell'ENEA e di Padova con Elisabetta, dottoranda all'NNL, convegno COST a cura dell'EU Science Foundation, S. Feliù de Guixols, 2007).
Da poco NNL non è diretta da Roberto Cingolani (responsabile sotto il governo Fitto della programmazione scientifica in Puglia, e fruitore dei fondi alla ricerca della giunta Vendola), il quale ricopre dal 2003 la carica di Direttore dell'IIT di Genova, un Istituto che vuole essere il nostro MIT, quello di Boston, una fucina di brevetti e di collaborazioni con l'industria.
Proprio l'IIT è oggetto di una Interrogazione parlamentare in Commissione 5-02115, presentata da BACHELET, TOCCI e GHIZZONI lunedì 16 novembre 2009, seduta n.247, al Ministro dell'Economia e delle finanze, al Ministro dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca per sapere -:
-quando e con quale modalità si intenda rendere pubblico il rapporto indipendente commissionato nel 2007 dal Ministro dell'economia e delle finanze Tommaso Padoa Schioppa, affinché Parlamento e contribuenti possano autonomamente valutare se la prosecuzione e anzi l'aumento straordinario dei finanziamenti pubblici stabilito con il decreto-legge sia o meno congruo...
-se e come si intenda promuovere la soluzione di quello che agli interroganti appare duplice conflitto d'interesse, come chiaramente evidenziato nelle premesse;
-se il Governo abbia approvato, formalmente o informalmente, la trasformazione dell'IIT in funding agency.

Come si legge nell'interrogazione,
...l'IIT ha avviato un'ampia campagna di finanziamento di ricerche in tutti gli enti e le università italiane, in tal modo configurandosi come una funding agency con finalità paragonabili al Consiglio nazionale delle ricerche; ma, ad avviso degli interroganti, con due importanti differenze;
sovrabbondanza, anziché penuria, di risorse finanziarie (nell'articolo pubblicato sul settimanale l'Espresso in data 11 giugno 2009 a firma di Roberta Carlini viene reso noto che l'IIT dal 2004 ad oggi ha ricevuto finanziamenti per un totale 518,5 milioni di euro da parte dello Stato, di cui ha speso solo 108,5 milioni);
mancanza di trasparenza e di valutazione scientifica indipendente nell'allocazione e distribuzione e di una simile massa di risorse...
i due valutatori internazionali autori del rapporto hanno dichiarato, come emerge da un articolo della rivista SCIENCE, pubblicato in data 19 giugno 2009 a firma di Laura Margottini, che il rapporto da loro redatto muoveva critiche relative all'attività scientifica dell'IIT, giudicandola inferiore alle aspettative, frammentaria e disorganica rispetto alle principali aree di ricerca previste dal piano di ricerca dell'IIT, non coerente con il piano di ricerca della fondazione;
Nell'interrogazione vengono citati oltre al primo articolo su SCIENCE, il primo del 19 giugno 2009 VOL 324, pagina 1502, anche la replica, apparsa il 9 ottobre 2009, in cui il professor Cingolani ammette per la prima volta che quel rapporto del 2007 «rifletteva problemi tipici delle nuove istituzioni» (nel 2007 l'IIT esisteva tuttavia da quattro anni); ma malgrado ciò, dice, era stato considerato complessivamente positivo, e a riprova cita la prosecuzione dei finanziamenti governativi; il professor Cingolani menziona due successivi rapporti di valutazione dell'IIT (dicembre 2008 e maggio 2009), che sarebbero, invece, molto lusinghieri.
Questi due nuovi rapporti /valutazioni hanno il difetto, sottolineato dalla controreplica, sempre su Science, di essere redatti dal comitato tecnico-scientifico dell'IIT, che istituzionalmente collabora con il suddetto direttore Scientifico ed il comitato esecutivo dell'IIT nella definizione dei finanziamenti e delle priorità di ricerca; e non da un panel di valutazione indipendente.